2025年6月6日，《自然·通讯》期刊在线发表了题为《灵长类尾状核在多模态抉择中的不同神经群体编码和因果作用》的研究论文，该研究由中心顾勇研究组完成。在该研究中，顾勇研究组通过训练猕猴完成一个依赖多模态感觉刺激的抉择任务，同时进行神经元胞外电生理记录、微电流刺激以及可逆性药物失活等多种技术手段，发现了皮层和皮层下脑区在多感觉抉择功能中的高维神经表征存在很大差异，并证明了尾状核区域对猕猴基于多感觉信息的抉择行为具有因果贡献。
2025年5月30日，《Science Advances》期刊在线发表题为《Whole-Brain Mapping of Basal Forebrain Cholinergic Neurons Reveals a Long-Range Reciprocal Input-Output Loop between Distinct Subtypes》的研究论文，该研究由中心徐敏研究组等合作共同完成。本项工作首次明确了BFCN亚群的兴奋性输入网络和抑制性输入网络，发现BFCN→BLA整合来自皮层和丘脑的认知相关信息调控情绪，而BFCN→ACA则整合来自下丘脑和脑干的情绪和状态相关信息调控认知。
2025年5月19日，《自然•衰老》期刊在线发表了题为《靶向染色质重塑物BAZ2B减轻肝衰老和MASH纤维化》的研究论文由中心蔡时青研究组等合作完成，首次揭示表观遗传调控因子BAZ2B在肝脏衰老及代谢功能障碍相关性脂肪肝炎（MASH）纤维化中的关键作用，为开发新型治疗策略奠定理论基础。
2025年5月15日，中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心（神经科学研究所）刘丹倩研究团队组在《Cell Metabolism》在线发表题为《Hydrogen peroxide in midbrain sleep neurons regulates sleep homeostasis》的研究论文，首次揭示了过氧化氢（H₂O₂）作为氧化还原信号分子参与睡眠稳态调控的因果作用及其神经机制。
2025年4月30日，CELL期刊在线发表题为“Neural-activity-regulated and glia-mediated control of brain lymphatic development”的研究论文。该工作由中心杜久林课题组完成，首次发现脑膜淋巴系统发育的大脑调控机制，发现了“神经-胶质-成纤维细胞-淋巴”动态调控轴，为神经-免疫系统互作研究领域提供了新认知。
2025年4月24日，《eLife》期刊在线发表了题为《Stimulus representation in human frontal cortex supports flexible control in working memory》的研究论文，以及由专家撰写的Insight评论文章。该研究由中心俞青研究组完成。研究团队通过设计多层级的灵活工作记忆实验范式，结合功能性核磁共振与人工神经网络模拟，揭示了额叶和感觉皮层在工作记忆分布式皮层网络中的功能差异，为领域内关于额叶与感觉皮层等多脑区在工作记忆中的功能争论提供了重要的实验与理论证据。
2025年4月7日，《Cell Reports》期刊在线发表了题为《Age-dependent glial heterogeneity and traumatic injury responses in a vertebrate brain structure》的研究论文，该研究何杰研究组完成。
2025年4月14日，《Neuron》期刊在线发表题为《A Time Window for Memory Consolidation During NREM Sleep Revealed by cAMP Oscillation》的研究论文。该研究由、中心、徐敏研究组与张思宇研究组合作完成。研究团队的发现为理解睡眠依赖的记忆巩固机制提供了新的视角，为研发睡眠期人工记忆干预的新方法提供了重要参考。
2025年4月9日，孙衍刚研究团队在《Neuron》发表题为《Single-neuron projectome reveals organization of somatosensory ascending pathways in the mouse brain》的研究论文，绘制了躯体感觉上行通路的精细"交通地图"。
2025年4月3日， Cell期刊在线发表了题为 “Single-cell spatial transcriptome atlas and whole-brain connectivity of the macaque claustrum” 的研究论文，揭示了猕猴与啮齿类动物的屏状核结构、细胞类型和分布存在显著性差异。该成果为理解人类意识产生的进化机制提供了新的研究思路。
2025年3月26日，中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心（神经科学研究所）和脑认知与类脑智能全国重点实验室牵头，联合多家机构在《Nature Neuroscience》在线发表了题为《Projectome-based characterization of hypothalamic peptidergic neurons in male mice》的研究论文, 系统描绘了雄性小鼠下丘脑多肽能神经元的全脑投射模式。
3月24日，中国科学院脑科学与智能技术卓越中心，联合杭州华大生命科学研究院、临港实验室、腾讯AI实验室和上海脑中心等科研单位，利用覆盖全基因组范围的单细胞转录组和空间转录组技术，构建了具有单细胞分辨率的小鼠大脑图谱，相关成果在线发表在《Neuron》杂志，为大脑功能的理解提供了全新的空间视角。
3月20日，张哲研究组与其他团队合作在《Nature Metabolism》上发表题为《GLp-2 prevents antipsychoticsinduced metabolic dysfunction in mice》，揭示了胰高血糖素样肽-2（GLP-2）类似物替度鲁肽（teduglutide）在缓解奥氮平诱导的代谢紊乱中的潜在作用，并发现下丘脑腹内侧核（VMH）中表达前强啡肽原（Pdyn）的神经元在这一过程中扮演了关键角色。
2025年3月14日， 题为《猕猴额叶神经振荡控制序列工作记忆的几何表征》的研究论文于《Current Biology》期刊在线发表。王立平研究组通过在清醒猕猴上进行高通量电生理记录，发现了局部场电位的θ振荡（Theta, 4-8 Hz）能够灵活调控序列工作任务内感觉与记忆信息的群体编码，以促进感官刺激向工作记忆的转化。
