神经所光学成像公共平台成立于 2002 年,现有专业技术人员 7 名,由胡谦博士(qianhu@ion.ac.cn,电话 54921811)负责管理。平台配备了24 套大型光学成像设备:12 台共聚焦显微镜、4 台双光子显微镜、4 台高通量切片成像系统、1 台超高速共聚焦显微镜、1台超高分辨率荧光显微镜、1 台活细胞工作站、1台高空间分辨率共聚焦显微镜。平台每周开放 80 小时(周一至周五:上午 9:00 - 晚上 10;00, 周末:下午 2:00 - 晚上 10:00),每年进行约 3 万小时的光学成像实验,由经验丰富的专业技术人员提供实验咨询、使用培训、图像处理和分析等服务,是国内设备较先进、仪器使用率较高的光学成像公共平台。
平台由三个小组组成:
第一组位于生命科学实验楼一楼(A119 & A107,电话 54921734),配备了7 套大型光学成像设备:3 台 BRUKER 双光子显微镜、1 台 BRUKER 超高分辨率荧光显微镜、1 台 BRUKER 高速共聚焦显微镜、1 台NIKON A1R 正置共聚焦显微镜、1 台 NIKON Ti 活细胞工作站。其中,双光子显微镜主要用于活体动物(果蝇、斑马鱼、小鼠、大鼠)深部成像和全脑重构(边切片边成像或透明化大脑);超高分辨率荧光显微镜主要用于 dSTORM 超高分辨率成像和 TIRF 成像;高速共聚焦显微镜主要用于高时间分辨率成像、光刺激、透明化标本快速三维重构。
第二组位于生命科学实验楼四楼(A438 & A434,电话 54921820),配备了8套大型光学成像设备:1 台 BRUKER 双光子显微镜、5 台 NIKON (A1、A1+FLIM+FCS、A1R、C2)共聚焦显微镜、2 台 OLYMPUS FV1000 共聚焦显微镜。其中,双光子显微镜主要用于脑片、视网膜、斑马鱼、大小鼠大脑的深部成像;NIKON (A1、A1+FLIM+FCS、A1R、C2)共聚焦显微镜主要用于多标记固定标本高分辨率成像、大范围 3D 拼图、活细胞成像、FRAP、FRET、FLIM、FCS、FCCS 等实验。
第三组位于生命科学实验楼三楼(A331,电话 54921935),配备了 9 套大型光学成像设备:4 台 OLYMPUS FV3000 共聚焦显微镜、1台OLYMPUS SpinSR 高空间分辨率共聚焦显微镜(转盘式)、3 台 OLYMPUS VS120 高通量荧光成像系统、1 台 OLYMPUS VS200全脑尺度高通量荧光自动扫描系统。其中,FV3000 共聚焦显微镜主要用于多标记固定标本高分辨率成像(多视野或大范围 3D 拼图)、斑马鱼全脑重构、活细胞成像等实验;VS120/VS200 高通量荧光成像系统主要用于固定标本的明场成像或宽场荧光成像和大范围 2D 拼图;SpinSR 转盘式共聚焦显微镜主要用于长时程活细胞成像实验、FRAP实验等。
平台的图像处理和分析室提供大量商业化软件(AutoQuant、Image Pro Plus 3D、Imaris、Neurolucida、Neurolucida 360、Stereo Investigator、SVI Huygens Essential、Volocity、Voloom 等)和免费共享软件(ImageJ、Fiji、IMOD、NeuroStudio、TeraStitcher、Vaa3d 等)供用户使用,并可根据用户的需求建立图像处理和分析方法。2019年为满足所内用户日益增多的大数据分析的需要,平台编写了可用于大数据剪裁、浏览、神经元追踪(利用著名的 Simple Neurite Tracer 和 NeuroStudio 软件)的 ImageJ 插件 Neurite Tracer nn。
神经所光学成像公共平台实行有偿服务,所内外用户均可通过中科院仪器设备共享管理平台(http://sample.cas.cn/)预约实验(所外用户需先电话54921811 咨询实验)。欢迎广大研究人员前来使用,想了解更多请下载《神经所光学成像平台手册》。