目前电镜室承担所内各研究课题组的电镜实验任务，可提供以下成熟的技术和服务：
1. 常规电镜样品的前期处理和制备
固定、漂洗、脱水、浸透、包埋、定位和超薄切片技术等一系列实验过程。
2. 免疫电镜（IEM）技术
免疫电镜技术是利用抗原与抗体特异性结合的原理，在超微结构水平定位的技术。特异性抗体经不透明标记后电子密度增大，便于电镜观察，目前使用较多的是胶体金标记技术。
3. 自动条带式超薄切片连续收集扫描成像（ATUM-SEM）技术
自动条带式超薄切片连续收集扫描成像技术主要利用超薄切片条带式收集装置稳定收集大批量纳米级连续切片，常用于分析脑组织体积样品的连通性。用SEM对收集到的连续超薄切片（30-70nm）进行序列成像，得到大量的序列图像，形成超薄切片库。这些序列图像经过自动识别、对齐，最终实现纳米级的三维重建。
4. 高压冷冻-冷冻替代技术
高压冷冻-冷冻替代技术在神经组织超微结构研究中是一种高效的冷冻固定技术，可将活的组织或细胞在迅速冻结到77K，与传统的化学固定方法相比，该方法具有以下优点：1.具有更快的固定速度，能捕捉瞬间的生理状态；2.可以获得更多原始的生理结构；3.有更高的分辨率，高压冷冻之后，样品通常需要通过冷冻替代过程。
5. 透射电镜样品的观察
①用于生理和病理情况下生物组织、细胞样品的超微亚细胞结构的高倍、高分辨率数码图像采集；
②脑片、单层细胞和菌体细胞的平板定位包埋；
③纳米材料和有机化合物的定量检测分析；
④模式动物如果蝇、斑马鱼、鼠脑部发育超微结构的观察和细胞学比较；
⑤提供超微病理图片的分析和图像处理。
6. 扫描电镜样品的观察
①能够直接观察较大体积样品表面的三位立体结构，具有明显的真实感;
②放大范围很宽，可以从10-20倍与10万-20万倍连续变化。即使在高倍观察时，也能获得足够清晰的图像；
③样品制备非常方便，如果是金属导电样品，直接就可以观察，如是非导电材料，只要镀上一层导电金属碳膜，就可以观察；
④由于扫描电镜的图像是按照信号顺序依次记录的，因此有利于图像分析与处理。
